Pieces of the Human Evolutionary Puzzle: Who Was Australopithecus sediba?

Few things remain as mysterious—or controversial—as our own history as a species. However, a series of papers released in Science may add another piece to the puzzle: Four papers draw back the curtain on Australopithecus sediba, announced earlier this year, detailing morphological features of the hand, foot, pelvis, and skull that may establish this species within the ancestral lineage of modern humans.

                    Fig.Courtesy of Steven Churchill, Duke University.

In a subterranean cave at Malapa, South Africa, approximately 25 miles (40km) from Johannesburg, the remains of numerous hominins identified as Australopithecus sediba have lain between layers of flowstone—a type of rock that forms in caves, similar in composition to stalagmites and stalactites, except as the name implies, this rock forms in a layer that “flows” across the surface. Flowstone is rich in uranium, which decays into lead. By measuring the amount of uranium and lead present in the stone, scientists were able to date the flowstone to between 1.977 and 1.98 million years ago. This date has been applied to the fossils themselves (which are too old to be directly dated), making them older than the oldest known fossils of the genus Homo (1.90 Ma).

  Fig.Courtesy of Peter Schmid

But what makes the fossils curious is their unique blend of traits. The foot and ankle, for example, suggest that Au. sediba was certainly bipedal, but it had not completely given up its arboreal tendencies. Au. sediba has a rudimentary arch and evidence indicates that it may have possessed an Achilles tendon which would have aided in bipedalism but its ape-like heel would have been poor at absorbing weight from walking or running. The ankle demonstrates less flexibility than that of apes, but more than is possible for the modern human foot. These elements in combination lead researchers to suggest that Au. sediba may have been unique in both its climbing and walking styles.

The pelvis may challenge The Obstetric Hypothesis, according to Steven Churchill and colleagues, which maintains that the larger brains of early Homo facilitated changes to the pelvis making them short, broad, and more bowl-like rather than broad, flat and flaring like those observed in the fossils of the australopithecines. The pelvis of Au. sediba is unusual because the species was small-brained, so the changes to the pelvis—at least in this case—were not to accommodate larger brained offspring, and may require us to rethink our understanding about the development of the modern pelvis. Given the evidence for bipedalism in this species, the relationship between the pelvis and terrestrial habitation may warrant closer investigation.

এক ধানগাছে বারবার ধান...

নিজের উৎপাদিত ধানক্ষেতে সামনে ডঃ আবেদ চৌধুরী

বাংলাদেশের মাটিতে প্রথম জীবনবর্ধিত ধান। জিনবিজ্ঞানী আবেদ চৌধুরীর চার বছরের গবেষণায় একফসলি ধান এখন পরিণত হলো দোফসলিতে..

সে অতি প্রাচীনকালের কথা। তখন বঙ্গীয় বদ্বীপ অঞ্চলের বসতি স্থাপনকারীরা মাছ আর পশুপাখি শিকার করে জীবিকা নির্বাহ করত। শিকারের কাজে নদীর তীরে গেলে তারা একধরনের ঘাসজাতীয় উদ্ভিদের দেখা পেল। আগ্রহ নিয়ে কাছে যেতেই ওই ঘাসের গায়ে খুঁজে পেয়েছিল একধরনের দানাদার শস্য। সবুজ শস্য পেকে হলুদ হলে তারা গাছসহ তা কেটে বাড়িতে নিয়ে এল। খোসা ছাড়ানো ধান সেদ্ধ করে খেতে শুরু করল তারা। এভাবে শুরু হলো ধান চাষ, বর্ধিত হতে লাগল জনপদ, সভ্যতা, নগর আর রাষ্ট্র।
কালপরিক্রমায় ধান হয়ে উঠল আমাদের প্রধান খাবার।

দানাদার এই শস্যটি পেকে উঠলেই কৃষক গাছসহ তা কেটে উঠানে নিয়ে আসে। এবং ধরেই নেওয়া হলো আম-কাঁঠালের মতো বছরের পর বছর টিকে থাকার সৌভাগ্য ধানগাছের হবে না। ধানবিজ্ঞানী আবেদ চৌধুরী এটা কোনোভাবেই মানতে পারছিলেন না। ওরিজা সেটিভ নামের এই ঘাসজাতীয় গাছে ধানের দ্বিতীয় জন্ম নিয়ে তিনি বছরের পর বছর পরীক্ষা-নিরীক্ষা চালিয়ে যেতে লাগলেন। একসময় এল সফলতা। বাংলাদেশের মাটিতেই উদ্ভাবিত হলো বিশ্বের প্রথম জীবনবর্ধিত ধানের জাত। সংক্ষেপে আবেদ চৌধুরী এর নাম দিয়েছেন জীবধা।
চার বছরের গবেষণায় আবেদ চৌধুরী একফসলি হিসেবে পরিচিত ধানগাছকে দোফসলিতে পরিণত করলেন। বোরো ও আউশ মৌসুমের জন্য এমন চারটি নতুন ধানের জাত উদ্ভাবন করলেন, যা কমপক্ষে দুবার ফলন দেবে। বাংলাদেশের মৌলভীবাজার জেলার কুলাউড়া উপজেলার কানিহাটি গ্রামে নতুন এই জাতের ধান চাষ এরই মধ্যে শুরু হয়েছে। জীবধা এখন অন্যান্য অঞ্চলের কৃষকও চাষ শুরু করেছেন।
মৌলভীবাজারের ছেলে আবেদ চৌধুরী যুক্তরাষ্ট্রে কৃষি বিষয়ে উচ্চশিক্ষার লক্ষ্যে চাকরি নিয়ে পাড়ি জমিয়েছিলেন দ্বীপ মহাদেশ অস্ট্রেলিয়ায়। সেখানকার জাতীয় গবেষণা সংস্থায় ধানের জিন নিয়ে গবেষণা করে কাটিয়ে দিয়েছেন জীবনের ২০টি বছর। সার ছাড়া ধানের চারা তৈরি থেকে শুরু করে উন্নত জাতের ধান উদ্ভাবন করেছেন তিনি। পেশাগত কারণে বিদেশের মাটিতে গবেষণা করলেও দেশ নিয়ে তাঁর চিন্তা ছিল ভিন্ন। গ্রামের বাড়ি মৌলভীবাজারের কানিহাটিতে নিজের হাতে গড়ে তুলেছেন খামার। খড় বা নাড়া থেকে কৃষকদের ধান সংগ্রহ করার পদ্ধতি তাঁকে ভাবিয়ে তোলে। কিছু খড় থেকে কয়েক মাস পর যদি ধান পাওয়া যায়, তাহলে ধানগাছ জমিতে রেখে যত্ন নিলে কেন তা হবে না—এই প্রশ্ন জাগে তাঁর মনে।

দ্বিতীয় জন্মের রহস্য
আবেদ চৌধুরী খেয়াল করেন, একটি ধানগাছ পরিণত হওয়ার পর তা থেকে ৬৫টি শিষ বের হয়। এর মধ্যে ৪০টি শক্তিশালী ছড়া বের হয়, বাকিগুলো বের হতে পারে না। গোড়াসহ গাছ কেটে ফেললে বের না হওয়া ছড়াগুলো আর কখনো আলোর মুখ দেখে না। ৩৫ সেন্টিমিটার ওপর থেকে ধান কেটে নিয়ে সঠিক পরিচর্যা করলে আলোর মুখ না দেখা ২৫টি ছড়া আলোর মুখ দেখতে পারে। একবার ধান কাটার পর ইউরিয়া সার দিলে ৫০ থেকে ৫৫ দিনের মধ্যে গাছ থেকে ধান বের হয়।
আবেদ চৌধুরী তাঁর কাছে সংরক্ষিত চীন, ফিলিপাইনসহ বিশ্বের বিভিন্ন দেশ থেকে আনা ধানের জাত কানিহাটিতে চাষ শুরু করলেন। যে জাতগুলোর ধান পাকার পর কেটে নিয়ে গেলে আবার ধানের শিষ বের হয়, সেগুলো আলাদা করলেন। এভাবে তিন থেকে চারটি জাত বের করলেন তিনি। তিন বছর ধরে এই জাতগুলো চাষ করে দেখলেন, নিয়মিতভাবে এগুলো দ্বিতীয়বার ফলন দিচ্ছে।
যেসব উঁচু জমিতে বছরে একবারের বেশি ফসল হয় না, সেখানে জীবধা চাষ করা অনেক লাভজনক। প্রথমবার এক বিঘা জমিতে চাষ করতে দুই থেকে আড়াই হাজার টাকা খরচ পড়ে। পাকা ধান আগা থেকে কেটে নেওয়ার পর ওই জমিতে ৩০০ টাকার ইউরিয়া সার ছিটাতে হয়। ৫০ থেকে ৫৫ দিন পর আবারও ওই গাছে ধান ধরে।
গত দুই বছরে চাষের অভিজ্ঞতায় দেখা গেছে, নতুন এই জাত চাষ করলে প্রথমবারের তুলনায় দ্বিতীয়বার অর্ধেক পরিমাণে ধান হয়। উঁচু জমিতে এই জাতের ফলন ভালো হয়। তিন বছর ধরে কানিহাটি গ্রামে চার একর জমিতে এই জাতের চাষ করে সফলতা পাওয়া গেছে।
কৃষি মন্ত্রণালয়ের হিসাবে, দেশের ২৮ লাখ একর জমি একফসলি। এর মধ্যে প্রায় ১০ লাখ একর উঁচু জমিতে এই জাতের চাষ সম্ভব। এতে বছরে ২০ থেকে ৩০ লাখ টন অতিরিক্ত ফসল উৎপাদন করা সম্ভব। গড় উৎপাদন খরচ আগের চেয়ে অর্ধেকে নেমে আসবে।

কৃষকের জ্ঞান এগিয়েছে বিজ্ঞানীর হাত ধরে
আবেদ চৌধুরী এ ব্যাপারে বলেন, অনেক আগে থেকে কৃষক নাড়া বা খড় থেকে ধান সংগ্রহ করত। কিন্তু তা সব ধান থেকে এবং সব সময় পাওয়া যেত না। যা পাওয়া যেত, তা খুবই সামান্য। নতুন এই জাত থেকে নিশ্চিতভাবে প্রথমবারের চেয়ে অর্ধেক পরিমাণ ধান পাওয়া যাবে।
কোনো একটি জমি যতবার চাষ দেওয়া হবে, ততবার মিথেন গ্যাস ও কার্বন ডাই-অক্সাইড নির্গত হবে। একবার চাষ দিয়ে দুবার ফসল উৎপাদন করলে উৎপাদন খরচ কমে যাওয়ার পাশাপাশি তা কার্বন ডাই-অক্সাইড নিঃসরণ কমিয়ে এনে জলবায়ু পরিবর্তনে ভূমিকা রাখবে। জানান আবেদ চৌধুরী।
আবেদ চৌধুরী গত বোরো মৌসুমে কানিহাটি গ্রামের একটি ২৫ বর্গমিটারের প্রদর্শনীখেতে বোরো ধানের চারা রোপণ করেছিলেন। এ খেতে সাধারণভাবে পরিমাণমতো ইউরিয়া সার প্রয়োগ করা হয়। সঠিকভাবে সেচ ও পরিচর্যা করে ১৩০ দিনের মধ্যে ৮৫ সেন্টিমিটার থেকে এক মিটার উচ্চতার গাছে প্রথমবারের মতো ধান বেরিয়ে আসে। আর এই ১৩০ দিনের মধ্যেই মাটি থেকে ৩৫ সেন্টিমিটার উচ্চতায় পরিকল্পিতভাবে ধান কেটে নিতে হয়েছে। প্রথমবারের কেটে নেওয়া ধানখেতে নতুন করে কোনো প্রকার চাষ ছাড়াই শুধু হালকাভাবে ইউরিয়া সার প্রয়োগ করে মাত্র ৫২ দিনের মাথায় দ্বিতীয়বারের মতো ব্যাপক ফসল উৎপাদিত হয়।
প্রথমবারের নতুন ধান কেটে নেওয়ার পর হিসাব করে দেখা যায়, হেক্টরপ্রতি এ ধান উৎপাদন হয়েছে ৬ দশমিক ৪ মেট্রিক টন। প্রথমবারের ফসল কেটে নেওয়ার পর প্রতি হেক্টরে ধান উৎপাদিত হয় তিন মেট্রিক টন। একই ধানগাছ থেকে তৃতীয়বারের মতো ফসল হেক্টরপ্রতি প্রায় তিন মেট্রিক টন উৎপাদন হওয়ার সম্ভাবনা রয়েছে, যেখানে সরকারি হিসাব অনুযায়ী হেক্টরপ্রতি ধান উৎপাদন হয়ে থাকে তিন থেকে চার মেট্রিক টন।
জীবধা নিয়ে আবেদ চৌধুরীর পরিকল্পনা বিস্তর। তিনি এই জাতগুলোকে দেশের কৃষকদের কাছে পৌঁছে দিতে চান। জাত ভালো হলে এটা কৃষক থেকে কৃষকের হাতে পৌঁছে যাবে—এটাই তাঁর ভরসা। যেমন করে বাংলা অঞ্চলে একফসলি ধানের বিস্তার হয়েছিল, তেমনি করে জীবধাও সারা দেশে ছড়িয়ে পড়বে। সেদিন হয়তো দূরে নয়, জীবনবর্ধিত ধান (জীবধা) বাংলাদেশের সীমানা ছাড়িয়ে সারা পৃথিবীতে ছড়িয়ে পড়বে।

ড. আবেদ চৌধুরী: বংশগতিবিষয়ক বিজ্ঞান গবেষক, বিজ্ঞান লেখক। অস্ট্রেলিয়ায় যৌথ গবেষণায় একদল অস্ট্রেলীয় বিজ্ঞানীর সঙ্গে ফিস (ইন্ডিপেনডেন্ট সিড) জিন আবিষ্কার করেন। ফিস জিনের বীজ অনেকাংশে সারবিহীনভাবে উৎপাদন করা সম্ভব। বর্তমানে অস্ট্রেলিয়ায় গবেষণাকাজে নিয়োজিত আছেন।

সংগ্রহ: প্রথম আলো, ৯ সেপ্টেম্বর ২০১১

Lichens Vs THe Almighty Prions

                                                                                                                                                                      By Jennifer Frazer | July 25, 2011
If you had to choose the world’s most indestructible biological entity, it would be hard to do better than the prion. It’s the Rasputin of biology: cook them, freeze them, disinfect them, pressurize them, irradiate them, douse them with formalin or subject them to protein-cleaving proteases, and yet they live.

Well, not literally live. After all, they’re only proteins.

Prions — infectious misfolded proteins –  have survived the pressure-cooker innards of autoclaves, the stout metal sterilizers that are the backbone of laboratory, hospital, and surgical sterilization. And they have survived for years in the punishing conditions of the outdoors — wind, cold, rain, snow, ice, heat, and ultraviolet radiation.

These two points should strike fear in the hearts of mammals everywhere, for prions cause incurable fatal neurodegenerative wasting diseases and dementias of the worst imaginable sort — the kind that swiftly strike down the hale and healthy in their prime.

If you are unfamiliar with prion diseases, that is only because you did not know they were caused by prions. In mammals: scrapie, chronic wasting disease, bovine spongiform encephalopathy, also known as mad cow disease. In humans: kuru, Creutzfeldt-Jakob Disease​, and variant Creutzfeldt-Jakob Disease, a tidier name for, well, mad-cow disease.

Once symptoms appear in humans, tremors, convulsions, personality changes, hallucinations, and uncontrollable fits of laughter can precede death, usually within six months or so. Deer and elk slowly emaciate and glaze over mentally under the effects of the chronic wasting disease prion. Sheep with scrapie scrape the fleece from their presumably itchy backsides, and cattle with mad cow stumble around aggressively before succumbing.

Are Neanderthals the missing link between Human and Apes?!!!....

Homo habilis (the first homo, 2.2-1.6 million years ago)

Our universe is constructed from a multitude of various materials. It is dynamic in shape and form due to a multitude of various processes and interactions between these materials. To the human, however, in his need to establish his place and purpose in the universe, the most important material is biological material and the most important process is evolution, far it is only here that the human can learn to understand him, an understanding which is vital to his survival.

Many evolutionists, anthropologists, scientists have surmised and conjectured about the human over the centuries, and still do, but the truth about the human may be found only through factual knowledge. But that factual knowledge lies in a process called evolution. The human is what evolution made him.

Man has been a tribal animal since he first walked erect, more than four million years ago. With the impediment of being bipedal, man could not out-climb or outrun his predators. Only he could hold his predators through tribal co-operation.

The word hominidae is used to describe the total member species of the human family that have lived since the last common ancestor; the ancestor of both man and the apes. A hominid is an individual species within that family. Paleoanthropology is the field of science which studies the human fossil record. It is the intersection of the disciplines of paleontology (the study of ancient life forms) and anthropology (the study of humans). Each hominid name consists of a genus name (e.g. Australopithecus, Homo) which is always start with upper case, and a species name (e.g. africanus, erectus) which is always in lower case.

ডেঙ্গু ঠেকাবে এডিস মশা!!!

ডেঙ্গু জ্বরের জন্য দায়ী এডিস মশা দিয়েই হয়তো এবার ডেঙ্গু ভাইরাসের বিস্তার ঠেকানো যাবে। অস্ট্রেলিয়ার বিজ্ঞানীরা বলছেন, তাঁরা ডেঙ্গু জ্বরের ভাইরাস প্রতিহত করতে পারে এ ধরনের মশা ‘উত্পাদন’ করেছেন। বিজ্ঞান সাময়িকী নেচার-এ প্রকাশিত দুটি গবেষণা প্রতিবেদনে বিজ্ঞানীরা বলেছেন,তাঁরা এডিস মশার শরীরে উলবাকিয়া নামের একধরনের ব্যাকটেরিয়া প্রবেশ করিয়ে ডেঙ্গু ভাইরাস বিস্তার রোধে সক্ষম হয়েছেন।প্রতিবেদনে বলা হয়েছে, উলবাকিয়া ব্যাকটেরিয়ায় আক্রান্ত স্ত্রী মশারা এ জীবাণু সহজেই তাদের পোনাদের মধ্যে সংক্রমিত করে। ওই ব্যাকটেরিয়ার প্রভাবে সেগুলো সম্পূর্ণভাবে ডেঙ্গু ভাইরাসমুক্ত হয়। বিজ্ঞানীরা বলছেন, মানুষের দেহে ডেঙ্গু সংক্রমণ প্রতিরোধে প্রকৃতিতে এ মশা অবমুক্ত করা যেতে পারে। গবেষক দলের প্রধান মোনাশ বিশ্ববিদ্যালয়ের বিজ্ঞান অনুষদের ডিন স্কট ও’নীল বলেন, ‘আমরা উলবাকিয়া ব্যাকটেরিয়া আক্রান্তপ্রধান যে বৈশিষ্ট্য লক্ষ করেছি, তা হচ্ছে তাদের ডেঙ্গু ছড়ানো কমিয়ে দেওয়ার সক্ষমতা।’

Boilogical Poetry: Part 01

From: “George Mayhew”

“One truth in life is the need to laugh at difficult situations.  Humour can make a difficult task more enjoyable.  I think that this group is uniquely suited to understand the repetitious nature of high throughput sequencing.  So I'm passing along a piece of humour constructed by one of our lab technicians.  Feel free to pass it along to your technicians or anyone else who might appreciate the inside humour.”--George Mayhew

(with sincere apologies to the musical group Chumbawumba)

                "Labgrumping"

   (to the tune of "Tubthumping" by Chumbawamba)

I take gels down, and put 'em up again,

Wolobachia- one Parasite to Kill all the bugs!

Wolobachia is a bacterial genus which infects arthopod species, which includes a high proportion of insect i.e. more than 60% are insects. Mosquitoes are incredibly successful parasites and cause millions of human deaths every year through the infections they spread. But they are no match for the most successful parasite of all – a bacterium called Wolbachia. It infects around 60% of the world’s insect species and it could be our newest recruit in the fight against malaria, dengue fever and other mosquito-borne infections.

Can this actually outperform that?

However, The bacterium was first identified in 1924 by Marshall Hertig and S. Burt Wolbach in Culex pipiens, a species of mosquito and Hertig formally described the genus in 1936 as Wolbachia pipientis, The parasite doesn’t generally infect Mosquitos But Scott O’Neill from the University of Queensland is leading a team of researchers who had developed a strain that not only infects mozzies, but halves the lifespans of infected females. Now, as the year comes to an end, they’re back with another piece of good news – their life-shortening bacteria also guard the mosquitoes from other infections. Infected insects are less likely to carry parasites that cause human disease, and those that do won’t live long enough to spread them. It’s a significant double-whammy that could have a lot of potential in controlling mosquito-borne diseases.